Número 9 narra la historia de un robot cuya conciencia despierta en una Tierra posapocalíptica, en la que ya no existen los seres humanos; el protagonista se unirá a otros de su misma especie para combatir contra unas monstruosas criaturas mecanizadas que pretenden exterminarlos, sin que ninguno de ellos conozca la razón de esa guerra interminable.